当然这十余万于家军，已经不需于孝天自己来养活了，现在他可以命户部和兵部直接给他麾下的兵马调拨粮饷，名义上这些于家军，都换上了一身明军的马甲罢了。
为了更快的掌控住整个大明的局势，于孝天在京畿一带留驻了三个精锐混成旅，除了京师留驻一个旅之外，其余的两个混成旅则以**营的编制，分驻在怀柔、蓟州、天津卫、通州、保定等地，对京师形成拱卫之势。
至于剩下的七万多于家军，在于孝天控制了京师局势之后，便开始逐步的被派往各地驻防。
于家军不同于其他旧式军队，他们对于后勤依赖性很强，特别是有关他们使用的武器弹药，几乎全部要靠福建那边进行供应，十万大军集中在北方驻防，会给于家军造成沉重的后勤负担。
所以于孝天一边扩军的同时，一边将兵马调往南方，分驻在山东、南直隶、湖广、河南等地，主力基本上是沿着长江一线进行安置。
这么一来，后勤部门给这些兵马进行补给的时候，就可以先走海路到松江府，然后转入长江逆流而上，以船运来维持这些兵马的所需。
到了十月间的时候，陕西洪承畴方面传回了一个相当不错的消息，在孙传庭的配合之下，他们东西两面夹击，将罗汝才所部从湖广赶到了南阳一带，孙传庭领兵赶赴南阳坐镇，逼得罗汝才不得不放弃继续留在南阳一带活动，率部逃回了陕西洛南一带。
结果洪承畴已经提前在洛南一带布置好了埋伏，当罗汝才率部逃入洛南一带之后，立即便被洪承畴率兵堵在了洛南南面的八里桥一带。
洪承畴派出于孝天给他的两个营的于家军主力，另外又调集了数千新收编的一些陕兵，猛击罗汝才所部。
结果罗汝才当场被一颗米涅弹击中了小腹，身负重创落马被擒，而他麾下率领的三万多流民军，也当即被洪承畴打的冰消瓦解，俘获流民军兵将近两万人之多。
洪承畴果真杀心颇重，大捷之后立即便下令将罗汝才所部之中两千多核心的人员和头领全部屠杀，剩下的则遣散回乡进行安置，或者干脆直接就地安置，将其转化为了农民，使得罗汝才这伙流民军彻底被剿灭掉，而且再无重新复起的可能性。
这个消息对于于孝天来说，当然是个相当不错的好消息，于是他立即令中书省拟旨，重重的褒奖了洪承畴和孙传庭一番，并且拨发三万两白银，作为犒赏之用。
这个时候各路流民军算是知道了于家军的厉害，原来他们没有和于家军打过交道，根本不清楚于家军到底厉害在什么地方，但是经过这段时间和洪承畴、孙传庭过招之后，他们才发现，以前他们对付官军使用的那些老办法似乎都不管用了。
不管他们使出什么计谋，不管他们的兵将多能打，但是只要和洪孙二人麾下的那支全部装备火-枪的于家军碰上，就只有被一边倒的屠杀的份。
李自成刚刚缓过来一口气，便又被洪承畴盯上了，洪承畴这一次没有先拿李自成开刀，而是先集中精力，干掉了混十万马进忠、整齐王张胖子、满天星张大受等几路流民军，逼得他们或散或降，接着又会和孙传庭，干掉了罗汝才一部，使得李自成所部虽然保存了他们的主力，但是也失去了其它几路流民军的配合。
崇祯十二年底，张献忠在孙传庭的追击之下，逃入到了汉中，洪承畴遣一个营的于家军，另外佐以麾下猛将曹变蛟率领五千新编陕兵，入汉中一带开始追讨张献忠所部。
张献忠在汉中一带被逼无奈之下率领残部的两万多流民军，和曹变蛟所部进行了一场决战，起初曹变蛟率兵和张献忠交战并未占到便宜，张献忠亲自率军猛击曹变蛟所部，曹变蛟兵力比较少，架不住张献忠所部的猛攻，于是只得败退。
张献忠看到曹变蛟被击退，兴致大起于是立即挥师掩杀，但是当曹变蛟率部逃出十几里进入一个狭窄的山谷之后，却在山谷一头停驻了下来，回身死扛张献忠所部，将张献忠麾下的六七千兵马引入到了这个山谷之中。
张献忠是个老油条，在前锋进入山谷之后，感觉到事情似乎有点不对头，便下令剩下的兵马不再进入山谷。
结果进入山谷的那六七千张献忠的手下，被一支于家军拦腰截断在了山谷之中，配合另一端的曹变蛟，将这六千多张献忠的部下堵在了山谷之中，乱枪齐发，地雷不断的被引爆，结果这六千多张献忠的手下有两千多人当场被杀，剩下的全部弃械投降，成了官军的俘虏。