于孝天在福建经营十几年，势力早已是根深蒂固，朝廷大军入闽对其进行进讨，他算是以逸待劳，主场作战，而入闽官军则算是异、地客场作战，福建又有大量的山地丘陵和河流，地形很复杂，并不适合大规模的用兵，想要把于孝天从福建连根拔起，是有着相当的难度的，
而且于孝天麾下的兵马不是一般的流寇，他麾下的兵马名义上也算是正牌的官兵，拥有完善的组织性，据说于家军还相当凶悍，这么多年来不管跟谁动手，从未遭遇过大的败绩，相传于家军装备了大量的火器，善用火器克敌制胜，对此洪承畴颇为担忧。
洪承畴这时候也把于孝天已经视作了大明最大的隐患，认为于孝天此人肯定有不臣之心，确实应该尽早将其清除掉为妙。
所以当听闻于孝天悍然北上进犯天津卫的时候，他第一反应就是此獠要兴师作反，趁乱攻取京师谋逆篡国。
但是当他又听闻于孝天驻兵天津卫，不再逼近京师，而是拦住了退往关外建奴大军，并且宣布要与之决一死战的消息的时候，洪承畴当真有些糊涂了。
于孝天既然是一个逆臣贼子，那么他没理由这么做呀！要是他和建奴死战一场的话，就算是他的兵马再厉害，当真能把建奴大军给击败，到时候也杀敌一千自损八百，将会彻底失去战力，到时候他领兵孤悬于天津卫，失去战力的残部，到时候便会成为朝廷的俎上之肉，任朝廷随便宰割了。
而且他的兵力也没有多少，建奴十万大军，而他不过只有区区三四万兵马，没理由能打得败如此嚣张的建奴大军，获胜的可能性可以说是微乎其微。
还有于孝天这一次北上为冤死在巨鹿的卢象升疾呼鸣冤，抨击杨嗣昌、高起潜、陈新甲、刘宇亮等人是导致卢象升冤死的罪魁祸首。
对此洪承畴对于孝天产生了一种强烈的好感，因为洪承畴和卢象升曾经算是合作关系，两个人私交还算是相当不错。
前几年的时候，朝廷命卢象升出任五省总督，和他配合清剿流民军，卢象升身为一个文官，却是一个奇才，善于控兵，御下极严，具有极强的人格魅力，非常善战而且悍勇，颇得洪承畴的敬佩。
后来卢象升被调往宣大任宣大总督，虽然不再和洪承畴配合，但是两个人还是有私信来往，讨论一些有关如何清剿流民军的方法，卢象升提出了不少不错的办法，洪承畴自觉受益匪浅。
这一次他听闻卢象升战死巨鹿，洪承畴听罢之后也非常难过，同时也很是气愤，因为他多少也听闻了一些，朝廷有心想要议和，杨嗣昌窥得圣意，一力主和，暗中限制卢象升的权力。
卢象升的性格他很了解，卢象升此次被夺情入卫，担纲兵马总督，肯定会主战，所以他和杨嗣昌在这件事上，是水火不容的，杨嗣昌作为权倾朝野的首辅大臣，肯定会给卢象升使绊子，但是没想到，杨嗣昌他们这次这么狠，居然会逼死卢象升。
洪承畴为此很是愤怒，但是却也无可奈何，现如今听到于孝天为卢象升疾呼鸣冤，怒斥杨嗣昌等人无耻，这一点让洪承畴觉得颇为解气，认为于孝天这个丘八虽然行事乖张，但是却还是颇有血性，敢于仗义执言，居然敢于直接怒骂杨嗣昌等这些朝廷大佬。
于是洪承畴渡过黄河之后，行至卫辉府便暂时停了下来，一是观望一下风向，看看接下来于孝天的下场，另外也等一下后续孙传庭所率的兵马。
可是这一等，就等出事了，接下来一连串的消息，把洪承畴给搞蒙了，先是于孝天率军力克建奴十万大军，阵斩了建奴奴酋多尔衮，接着朝廷便派兵试图趁机把于孝天灭掉，但是却又被于孝天打了个屁滚尿流，连吴襄都被于孝天的手下当场阵斩。
随即于孝天怒儿宣布要入京清君侧，领兵朝着京师攻进，这一下洪承畴被吓得不轻，他怎么都想不到于孝天麾下的兵马如此凶悍，建奴大军居然都不是他们的对手，干掉了建奴大军之后，他居然还有余力解决朝廷的两路精兵，接下来还有余力对京师发动进攻。
这一下他不敢怠慢了，赶紧催促孙传庭率领后续的陕兵赶上来，接着集结兵力赶往京师勤王。
但是他刚走到顺德府，尚未进入真定府，便又得知，于孝天居然领兵攻克了京师，并且控制住了京师，这一下洪承畴差点晕过去。
他想不出于孝天所部为何能如此善战，接二连三打出了这么多漂亮仗，京师的防御他是知道的，作为大明的都城，京师城墙坚固防御设施完备，而且还有不少官军驻防，加之京畿一带聚集的官军，兵力没有十万也有八万，于孝天所部兵力不足，按理说就算是他的手下都是万人敌，也不见得能这么轻松攻下京师的，可是他却偏偏还是做到了。